Uso del suelo como modulador de comunidades bacterianas: aproximación taxonómica a bioindicadores a nivel de familia en ecosistemas tropicales de El Salvador
DOI:
https://doi.org/10.66778/RM.v09ed01.01Palabras clave:
comunidades bacterianas, bioindicadores, microbioma tropical, diversidad beta, manglares, agriculturaResumen
Objetivo: este estudio caracterizó la estructura taxonómica de las comunidades bacterianas del suelo a nivel de familia en diferentes usos de suelo (bosques, manglares, playas y sistemas agrícolas) del Parque Nacional Barra de Santiago, El Salvador, para identificar taxones bioindicadores y su relación con variables fisicoquímicas.Metodología:se realizó la secuenciación de la región V4 del gen 16S rRNA y análisis multivariados para vincular la composición bacteriana con las propiedades del suelo. Resultados clave: se identificaron taxones diferenciales asociados a cada ambiente. Los bosques, con alta materia orgánica y pH neutro, fueron dominados por Hyphomicrobiaceae y Pirellulaceae. Los manglares mostraron predominio de Desulfobacteraceae, mientras que las playas albergaron comunidades únicas dominadas por Piscirickettsiaceae, reflejando presiones ambientales extremas. Los sistemas agrícolas exhibieron homogenización microbiana, vinculada a prácticas intensivas. El uso del suelo fue el modulador clave de las comunidades, con el pH, los metales (Cu) y el fósforo como principales impulsores. Conclusión: la identificación de familias como Desulfobacteraceae y Piscirickettsiaceae como bioindicadores específicos subraya su potencial para el monitoreo ambiental. Sin embargo, la homogenización en suelos agrícolas alerta sobre riesgos ecológicos, resaltando la necesidad de prácticas sostenibles.
Descargas
Referencias
Altieri, M. A., Koohafkan, P., y Holt-Giménez, E. (2012). Agricultura verde: Fundamentos agroecológicos para diseñar sistemas agrícolas biodiversos, resilientes y productivos. Agroecología, 7, 7–18.https://archive.foodfirst.org/wpcontent/uploads/2016/01/agricultura-verde-Altieri.pdf
Baldani, J. I., Videira, S. S., Teixeira, K. R. S., Reis, V. M., Oliveira, A. L. M., Schwab, S., Souza, E. M., Pedraza, R. O., Baldani, V. L. D., & Hartmann, A. (2014). The family Rhodospirillaceae. In E. Rosenberg, E. F. DeLong, S. Lory, E. Stackebrandt, & F. Thompson (Eds.), The prokaryotes: Alphaproteobacteria and betaproteobacteria (pp. 534–601). Springer. https://doi.org/10.1007/978-3-642-30197-1_300
Beltrán Pineda, M. E. (2014). La solubilización de fosfatos como estrategia microbiana para promover el crecimiento vegetal. Ciencia y Tecnología Agropecuaria, 15(1), 101–113. http:// www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_ arttext&pid=S0122-87062014000100009
Bryant, D. A., Costas, A. M. G., Maresca, J. A., Chew, A. G. M., Klatt, C. G., Bateson, M. M., & Ward, D. M. (2007). Candidatus Chloracidobacterium thermophilum: An aerobic phototrophic Acidobacterium. Science, 317(5837), 523–526. https://doi.org/10.1126/science.1143236
De la Lanza-Espino, G., Penié-Rodríguez, I., y Hernández-Pulido, S. (2004). Variación espaciotemporal del fósforo y el efecto de las corrientes locales en su distribución en la Bahía de Petacalco, Guerrero, México. Ciencias Marinas, 30(2), 311–322. https://www. redalyc.org/articulo.oa?id=48030204
Donaire Figueroa, K., Pérez Duval, A., Romero Calle, D. X., Cárdenas Alegría, O., y Álvarez Aliaga, M. T. (2017). Establecimiento y evaluación de dos métodos de pretratamiento de muestras de suelo para la extracción de ADN para el estudio de la diversidad bacteriana. Revista CON-CIENCIA, 5(1), 27–38. http://www.scielo.org.bo/pdf/rcfb/v5n1/v5n1_a02.pdf
Duke, N. C., Meynecke, J. O., Dittmann, S., Ellison, A. M., Anger, K., Berger, U., & Dahdouh-Guebas, F. (2007). A world without mangroves? Science, 317(5834), 41–42. https://doi.org/10.1126/ science.317.5834.41b
Enríquez-Velázquez, O., Aguilar-Aguilar, R., Valencia- Cantero, E., & Velázquez-Becerra, C. (2017). Perfil fisicoquímico y microbiológico de tres distintos suelos forestales y su efecto en el crecimiento de Pinus devoniana Lindl. Polibotánica, 44, 109–118. https://doi. org/10.18387/polibotanica.44.8
Fierer, N., Lauber, C. L., Ramirez, K. S., Zaneveld, J., Bradford, M. A., & Knight, R. (2012). Comparative metagenomic, phylogenetic and physiological analyses of soil microbial communities across nitrogen gradients. The ISME Journal, 6(5), 1007–1017. https://doi. org/10.1038/ismej.2011.159
Hartmann, M., Frey, B., Mayer, J., Mäder, P., & Widmer, F. (2015). Distinct soil microbial diversity under long-term organic and conventional farming. The ISME Journal, 9(5), 1177–1194. https://doi.org/10.1038/ismej.2014.210
Hung, Y. M., Lu, T. P., Tsai, M. H., Lai, L. C., & Chuang, E. Y. (2021). EasyMAP: A user-friendly online platform for analyzing 16S ribosomal DNA sequencing data. New Biotechnology, 63, 37–44. https://doi.org/10.1016/j.nbt.2021.03.001
Kuever, J. (2014a). The family Desulfobacteraceae. In E. Rosenberg, E. F. DeLong, S. Lory, E. Stackebrandt, & F. Thompson (Eds.), The prokaryotes (pp. 45–73). Springer. https://doi. org/10.1007/978-3-642-39044-9_266
Kuever, J. (2014b). The family Syntrophobacteraceae. In E. Rosenberg, E. F. DeLong, S. Lory, E. Stackebrandt, & F. Thompson (Eds.), The prokaryotes. Springer. https://doi. org/10.1007/978-3-642-39044-9_268
Laughinghouse IV, H. D., Smyth, A., Havens, K., & Frazer, T. (2022). Repensando el papel del nitrógeno y fósforo en la eutrofización de los ecosistemas acuáticos. UF/IFAS Extension (SGEF190s). https://doi.org/10.32473/edis- SG191-2022
Lladó, S., López-Mondéjar, R., & Baldrian, P. (2017). Forest soil bacteria: Diversity, involvement in ecosystem processes, and response to global change. Microbiology and Molecular Biology Reviews, 81(2), e00063-16. https://doi. org/10.1128/MMBR.00063-16
McDonald, D., Price, M. N., Goodrich, J., Nawrocki, E. P., DeSantis, T. Z., Probst, A., & Hugenholtz, P. (2012). An improved Greengenes taxonomy with explicit ranks for ecological and evolutionary analyses of bacteria and archaea. The ISME Journal, 6(3), 610–618. https://doi.org/10.1038/ismej.2011.139
Okamoto, N., Keeling, P. J., Leander, B. S., & Tai, V. (2022). Microbial communities in sandy beaches from the three domains of life differ by microhabitat and intertidal location. Molecular Ecology, 31(11), 3210–3227. https:// doi.org/10.1111/mec.16453
Pester, M., Knorr, K. H., Friedrich, M. W., Wagner, M., & Loy, A. (2012). Sulfate-reducing microorganisms in wetlands—Fameless actors in carbon cycling and climate change. Frontiers in Microbiology, 3, 72. https://doi. org/10.3389/fmicb.2012.00072
R Core Team. (2025). R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing. https://www.R-project. org/
Rosen, M. J., Callahan, B. J., Fisher, D. S., & Holmes, S. P. (2012). Denoising PCR-amplified metagenome data. BMC Bioinformatics, 13, 283. https://doi.org/10.1186/1471-2105-13-283
Sales Ordoñez, G., Aguirre Escalante, C., Cerna Cueva, A. F., Ortega-Silva, D. S., Pérez Hernández, V. E., Aguilar Carazas, N. W., y Reategui-Inga, M. E. (2024). Análisis de microorganismos funcionales y su relación con parámetros fisicoquímicos del suelo en un bosque reservado. Manglar, 21(1), 19–28. https://doi. org/10.57188/manglar.2024.002
Thompson, L. R., Sanders, J. G., McDonald, D., Amir, A., Ladau, J., Locey, K. J., & Eisen, J. A. (2017). A communal catalogue reveals Earth’s multiscale microbial diversity. Nature, 551(7681), 457–463. https://doi.org/10.1038/ nature24621
Tsiafouli, M. A., Thébault, E., Sgardelis, S. P., de Ruiter, P. C., van der Putten, W. H., Birkhofer, K., & Uteseny, K. (2015). Intensive agriculture reduces soil biodiversity across Europe. Global Change Biology, 21(2), 973–985. https:// doi.org/10.1111/gcb.12752
Vavourakis, C. D., Ghai, R., Rodriguez-Valera, F., Sorokin, D. Y., Tringe, S. G., Hugenholtz, P., & Muyzer, G. (2016). Metagenomic insights into the uncultured diversity and physiology of microbes in four hypersaline soda lake brines. Frontiers in Microbiology, 7, 211. https://doi. org/10.3389/fmicb.2016.00211
Publicado
Número
Sección
Licencia
Derechos de autor 2026 Miguel A. Moreno, Carlos Rivera, Jonathan Rogel Moreno, Ligia Muñoz Molina, Milagro Dolores Reyes Romero, Roberto Navarro Linares, Leonel Palomo, Mario Francisco Córdova Navas
Esta obra está bajo una licencia internacional Creative Commons Atribución-CompartirIgual 4.0.
